Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDB1Q16531 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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DDB1Q16531 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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DDB1Q16531 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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DDB1Q16531 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDB1Q16531 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDB1Q16531 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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