Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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SSX2Q16385 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SSX2Q16385 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX2Q16385 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX2Q16385 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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