Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK3Q16288 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK3Q16288 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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