Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F4Q16254 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F4Q16254 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms