Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
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NCOA1Q15788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
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NCOA1Q15788 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCOA1Q15788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
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NCOA1Q15788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
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NCOA1Q15788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NCOA1Q15788 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
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