Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERC1Q15751 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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HERC1Q15751 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERC1Q15751 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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