Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SF3B3Q15393 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B3Q15393 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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