Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN1Q15223 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NECTIN1Q15223 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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