Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRLQ15198 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms