Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKD1Q15139 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKD1Q15139 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms