Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3GAP1Q15042 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3GAP1Q15042 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms