Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPD2Q15021 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPD2Q15021 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms