Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ERV3-1Q14264 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERV3-1Q14264 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERV3-1Q14264 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERV3-1Q14264 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERV3-1Q14264 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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ERV3-1Q14264 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ERV3-1Q14264 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ERV3-1Q14264 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ERV3-1Q14264 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ERV3-1Q14264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERV3-1Q14264 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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