Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PDE6HQ13956 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PDE6HQ13956 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PDE6HQ13956 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PDE6HQ13956 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PDE6HQ13956 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6HQ13956 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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