Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPSQ13938 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPSQ13938 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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