Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALCAMQ13740 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALCAMQ13740 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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