Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR1Q13613 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR1Q13613 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR1Q13613 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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