Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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