Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED1Q13445 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms