Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SF3B2Q13435 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SF3B2Q13435 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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