Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMS2P3Q13401 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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