Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE3BQ13370 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
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