Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF1Q13351 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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