Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.227e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 213.35□□□□□ -0.277e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.297e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.317e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 512.62□□□□□ -0.397e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 512.6□□□□□ -0.397e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 512.49□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 212.48□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 212.47□□□□□ -0.417e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-205ENST00000415461 1021 ntTSL 312.41□□□□□ -0.427e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 212.29□□□□□ -0.447e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.527e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.527e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.557e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 311.44□□□□□ -0.587e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 411.27□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-218ENST00000450497 882 ntTSL 511.24□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.637e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 411.08□□□□□ -0.647e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-212ENST00000596750 906 ntTSL 310.94□□□□□ -0.667e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-217ENST00000589507 820 ntTSL 510.87□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AXIN2-204ENST00000577278 976 ntTSL 510.62□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.777e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.887e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 49.57□□□□□ -0.887e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.927e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 39.16□□□□□ -0.947e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC9.13□□□□□ -0.957e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-204ENST00000405068 2958 ntTSL 28.8□□□□□ -17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-226ENST00000479442 511 ntTSL 28.77□□□□□ -1.017e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.067e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 58.01□□□□□ -1.137e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-233ENST00000496159 463 ntTSL 27.37□□□□□ -1.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 37.34□□□□□ -1.237e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.267e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.327e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 36.42□□□□□ -1.387e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 45.79□□□□□ -1.487e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-212ENST00000435225 570 ntTSL 45.51□□□□□ -1.537e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 212.64□□□□□ -0.394e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.594e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 511.25□□□□□ -0.614e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-219ENST00000494828 621 ntTSL 48.81□□□□□ -14e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MST1-213ENST00000490966 829 ntTSL 58.41□□□□□ -1.064e-14■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 311.21□□□□□ -0.613e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 210.98□□□□□ -0.653e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.783e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 27.26□□□□□ -1.253e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 26.63□□□□□ -1.353e-10■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 39.1□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 SLC17A9-204ENST00000459704 2015 ntTSL 312.58□□□□□ -0.44e-19■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RAB17-207ENST00000416106 587 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-202ENST00000561711 644 ntTSL 313.62□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-221ENST00000569358 1273 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 511.36□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 510.57□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 8.1
SRSF9Q13242 RHOT2-213ENST00000565004 1014 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 8.1
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