Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MKRN3Q13064 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN3Q13064 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN3Q13064 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
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