Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 CDC42YLR229C 576 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 REC102YLR329W 795 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YIM1YMR152W 1098 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 CYC2YOR037W 1101 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 RFM1YOR279C 933 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ARA1YBR149W 1035 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SPS2YDR522C 1509 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 KIN2YLR096W 3444 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 PHO87YCR037C 2772 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SPT14YPL175W 1359 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 FDC1YDR539W 1512 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YIP5YGL161C 933 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 HIS6YIL020C 786 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 LOH1YJL038C 660 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YKL162CYKL162C 1209 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TAP42YMR028W 1101 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YOR114WYOR114W 885 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ICS2YBR157C 768 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 RPS9BYBR189W 588 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SNF2YOR290C 5112 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 HPR1YDR138W 2259 nt4.79□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SMF1YOL122C 1728 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 MTR10YOR160W 2919 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 VAC17YCL063W 1272 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 BUD25YER014C-A 462 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YIL025CYIL025C 375 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 VPS25YJR102C 609 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TVP38YKR088C 1014 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 NBP1YLR457C 960 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ATG34YOL083W 1239 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 INA17YPL099C 549 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 RAD52YML032C 1416 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ARO80YDR421W 2853 nt4.78□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YNR065CYNR065C 3351 nt4.78□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YER077CYER077C 2067 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 FLC1YPL221W 2382 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YCL068CYCL068C 783 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 snR83snR83 306 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 NUS1YDL193W 1128 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PHO13YDL236W 939 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 VAR1Q0140 1197 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 AIM18YHR198C 966 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 NDL1YLR254C 570 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 TYE7YOR344C 876 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 ARC40YBR234C 1155 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 IDS2YJL146W 1410 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 VBA2YBR293W 1425 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 TCO89YPL180W 2400 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 CWH43YCR017C 2862 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MET4YNL103W 2019 nt4.77□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PEP5YMR231W 3090 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 UBP10YNL186W 2379 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 DPB4YDR121W 591 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RSM27YGR215W 333 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RPL8AYHL033C 771 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 IST3YIR005W 447 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RAD27YKL113C 1149 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 GPI12YMR281W 915 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 DUG3YNL191W 1074 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YBR053CYBR053C 1077 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 BMT2YBR141C 1014 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 GZF3YJL110C 1656 nt4.76□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 GWT1YJL091C 1473 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YRB30YGL164C 1323 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YNR066CYNR066C 1311 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 SYF1YDR416W 2580 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 PAH1YMR165C 2589 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 FLO8YER109C 2400 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RDI1YDL135C 609 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 UBC8YEL012W 657 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 ISC10YER180C 804 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YGL088WYGL088W 366 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 BUD13YGL174W 801 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 SOL3YHR163W 750 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YIL171WYIL171W 330 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YJR038CYJR038C 363 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MAP1YLR244C 1164 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 DCS1YLR270W 1053 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 TEM1YML064C 738 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 MRPL3YMR024W 1173 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 DSS4YPR017C 432 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YPR059CYPR059C 387 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 LAS1YKR063C 1509 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YFL040WYFL040W 1623 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 POL31YJR006W 1464 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 YLR152CYLR152C 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 UGA3YDL170W 1587 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 APP1YNL094W 1764 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 HMRA1YCR097W 381 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 AIM7YDR063W 450 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 RPL24BYGR148C 468 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.74□□□□□ -1.65
CLF1Q12309 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.74□□□□□ -1.65
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