Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 SDS23YGL056C 1584 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 PAM18YLR008C 507 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 SFG1YOR315W 1041 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 SAD1YFR005C 1347 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 HCM1YCR065W 1695 nt4.67□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 MGA1YGR249W 1371 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 RSC3YDR303C 2658 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 PRP18YGR006W 756 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 YGR111WYGR111W 1203 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 RTA1YGR213C 954 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 VPS25YJR102C 609 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 LIP2YLR239C 987 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 SPC2YML055W 537 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 ARO4YBR249C 1113 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 TRS85YDR108W 2097 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 STD1YOR047C 1335 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 UBX5YDR330W 1503 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 YIL001WYIL001W 1542 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 BUD5YCR038C 1929 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 YOR365CYOR365C 2112 nt4.66□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 ISW2YOR304W 3363 nt4.65□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 TEL1YBL088C 8364 nt4.65□□□□□ -1.66
SLX4Q12098 CBS2YDR197W 1170 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 RNA15YGL044C 891 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 COX4YGL187C 468 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YHR173CYHR173C 339 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 RSM25YIL093C 795 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR156WYLR156W 345 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR159WYLR159W 345 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR161WYLR161W 345 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YML053CYML053C 639 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YOL075CYOL075C 3885 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 DSN1YIR010W 1731 nt4.65□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YPR1YDR368W 939 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 UBC8YEL012W 657 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 KXD1YGL079W 657 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YGL138CYGL138C 1038 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PFS1YHR185C 714 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 LOH1YJL038C 660 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 TVP38YKR088C 1014 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 IST1YNL265C 897 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PFK27YOL136C 1194 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 IPP1YBR011C 864 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 snR44snR44 211 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 POF1YCL047C 777 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 JHD2YJR119C 2187 nt4.64□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 VPS45YGL095C 1734 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 ART10YLR392C 1557 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 SEC59YMR013C 1560 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PER1YCR044C 1074 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 NHP10YDL002C 612 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PRP11YDL043C 801 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 AHP1YLR109W 531 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 DUG3YNL191W 1074 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YOR379CYOR379C 339 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YBR242WYBR242W 717 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YNR066CYNR066C 1311 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YIG1YPL201C 1386 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 FAR10YLR238W 1437 nt4.63□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 BCK2YER167W 2556 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 HSP42YDR171W 1128 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 IZH1YDR492W 951 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 MEI4YER044C-A 1227 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PSF2YJL072C 642 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 RFA3YJL173C 369 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 NKP2YLR315W 462 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YPT53YNL093W 663 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YOL107WYOL107W 1029 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YPL077CYPL077C 723 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YPR027CYPR027C 834 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 SUP45YBR143C 1314 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YHR202WYHR202W 1809 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 MSS4YDR208W 2340 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 PHM7YOL084W 2976 nt4.62□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 EPO1YMR124W 2832 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR152CYLR152C 1731 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 NUP133YKR082W 3474 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YSH1YLR277C 2340 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YFR057WYFR057W 456 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 GPP1YIL053W 753 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 YLR407WYLR407W 687 nt4.61□□□□□ -1.67
SLX4Q12098 SSO2YMR183C 888 nt4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.6 ms