Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBRQ0VD83 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms