Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLFN5Q08AF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFN5Q08AF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFN5Q08AF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms