Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLEQ07864 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLEQ07864 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLEQ07864 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLEQ07864 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLEQ07864 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLEQ07864 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLEQ07864 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLEQ07864 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms