Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PSME1Q06323 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms