Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN11Q06124 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms