Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALD1Q05682 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms