Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNEQ04844 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNEQ04844 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms