Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT17Q04695 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms