Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNC1Q01954 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms