Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A2Q01362 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A2Q01362 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms