Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F1Q01094 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms