Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTBN1Q01082 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms