Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms