Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLTCQ00610 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms