Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11AP98196 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms