Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD1P98174 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD1P98174 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD1P98174 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FGD1P98174 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FGD1P98174 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD1P98174 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD1P98174 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms