Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA4P83105 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms