Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIM1P81133 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIM1P81133 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIM1P81133 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIM1P81133 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIM1P81133 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIM1P81133 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms