Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NTHL1P78549 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTHL1P78549 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms