Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT85P78386 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT85P78386 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT85P78386 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT85P78386 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT85P78386 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT85P78386 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT85P78386 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT85P78386 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms