Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP1P78357 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP1P78357 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms