Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSNK2A1P68400 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSNK2A1P68400 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms