Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPNP63162 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPNP63162 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms